Molecular analysis of the nucleocapsid gene and 3' untranslated region of two infectious Bronchitis Virus field isolates from Iranian poultry farms

Authors

1 دانشکده دامپزشکی دانشگاه ارومیه

2 دانشکده دامپرشکی دانشگاه ارومیه

3 دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران

Abstract

Infectious bronchitis (IB) is an economically important disease of chickens. Due to the emergence of new variants of infectious bronchitis virus (IBV), the control of IB has become a serious problem for the poultry industry worldwide. In the present study, the nucleocapsid gene (N) and 3' untranslated region (UTR) of two IBVs isolated from Iranian poultry farms were sequenced and compared with other IBV strains. Based on nucleotide identity, the N gene and 3' UTR sequences of Iranian IBVs showed 90% similarity to the commonly used IBV vaccine strains, H52 and H120. However, based on phylogenetic analyses, Iranian IBVs were found to cluster separately from the IBV vaccine strains used in Iran as well as other IBVs isolated in China, Australia and the United States. It was concluded that IBVs circulating in Iran are genetically distinct from IBV vaccine strains that have been used in Iran for many years. Therefore, it is important to develop a new vaccine based on these newly identified strains for controlling IB in Iranian poultry farms.

Article Title [فارسی]

آنالیز مولکولی ژن نوکلئوکپسید و ناحیه غیر ترجمه شده انتهای 3’ دو ویروس برونشیت عفونی جدا شده از مرغداریهای ایران

Authors [فارسی]

  • karim mardani 1
  • کریم مردانی 2
  • احمد مرشدی 1
  • مهدی وصفی مرندی 3
  • علیرضا طالبی 1
Abstract [فارسی]

برونشیت عفونی یک بیماری مهم از نظر اقتصادی در ماکیان می باشد. به دلیل ظهور واریانتهای جدید ویروس برونشیت عفونی، کنترل این بیماری بعنوان یک مشکل جدی در صنعت طیور در دنیا مطرح است. در مطالعه حاضر، ژن نوکلئوکپسید (N) و ناحیه غیرترجمه شده انتهایی 3’ (UTR) دو جدایه ویروس برونشیت عفونی از مرغداریهای ایران تعیین توالی گردید و با سایر سویه های ویروس مقایسه گردیدند. توالیهای نوکلئوتیدی ژن N و ناحیه 3’UTR جدایه های ویروس برونشیت ایران دارای تشابه 90 درصدی با سویه های واکسنی مورد استفاده در مرغداریهای ایران شامل H52 و H120 بودند. اما براساس آنالیزهای فیلوژنتیکی، جدایه های ویروسی ایران در گروهی مجزا از سویه های واکسنی مورد استفاده در ایران و نیز سویه های جدا شده در چین، استرالیا و امریکا قرار گرفتند. با توجه به نتایج بدست آمده مشخص گردید که ویروسهای برونشیت عفونی در گردش در مرغداریهای ایران از نظر ژنتیکی از سویه های واکسنی ویروس که سالها است در مرغداریهای ایران استفاده می شوند مجزا می باشند. بنابراین تهیه یک واکسن جدید بر اساس سویه های در گردش ویروس برای کنترل بیماری در مرغداریهای ایران اهمیت زیادی دارد