Exon 2 Ovar-DRB1 gene polymorphism in the Iranian Sangsari sheep

Authors

1 دانشکده دامپزشکی دانشگاه سمنان

2 دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران

3 دانشکده دامپزشکی دانشگاه شیراز

Abstract

The major histocompatibility complex (MHC) plays a central role in the control of disease resistance and immune response. Extensive genetic diversity in MHC genes provides a valuable source for genetic improvement, via selection, in many domestic animals. Exon 2 of the class II MHC, termed Ovar-DRB1 in domestic sheep (Ovis aries), has been suggested as important disease resistance and immune response gene. We characterized Ovar-DRB1 in DNA samples from 138 individuals of a population of the Iranian Sangsari sheep breed using PCR-RFLP. Eight DRB1 alleles were identified among Iranian Sangsari sheep, including one previously unrecognized allele. Eight homozygous genotypes were observed: a, b, c, d, f, g, h and N. Genotype bb was the most common pattern (46 of 138). Heterozygous genotypes (ag, cb, cd, bf, and bN) were also observed. The observed homozygosity and heterozygosity values were 0.6377 and 0.3623, respectively, vs expected values of 0.220 and 0.779. Iranian Sangsari population deviate significantly from the theoretical proportions (FIS = 0.5283; p = 0.0005). In conclusion, PCR-RFLP analysis allows rapid identification of Ovar-DRB1 types and discrimination of homozygous and heterozygous genotypes. This study indicates that the exon 2 region of the Ovar-DRB1 gene is highly polymorphic in the Iranian Sangsari sheep breed.

Keywords


Article Title [فارسی]

بررسی تنوع اگزون دوم ژن Ovar-DRB1 در گوسفندان سنگسری

Authors [فارسی]

  • gholamraza nikbakhat 1
  • غلامرضا نیکبخت بروجنی 2
  • عبدالله درخشنده 3
  • رضا طالبنیا 2
Abstract [فارسی]

مجتمع سازگاری بافتی نقشی اساسی درکنترل مقاومت به بیماری و پاسخهای ایمنی دارد. تنوع ژنتیکی گسترده در ژن های مجتمع سازگاری بافتی سبب فراهم شدن یک منبع با ارزش برای بهبود ژنتیکی از طریق انتخاب در بسیاری از گونه های حیوانات اهلی می شود. از اگزون دو کلاس II مجتمع سازگاری بافتی در گوسفند اهلی (اویس آریس) می توان برای رسیدن به این هدف و مطالعات بعدی ژنتیک جمعیت استفاده کرد. در این مطالعه ژن Ovar-DRB1 در 138 نمونه DNA ی گوسفند ایرانی نژاد سنگسری با استفاده از روش PCR-RFLP مورد بررسی قرار گرفت. هشت آلل DRB1 در بین گوسفندان ایرانی نژاد سنگسری شناسایی گردید. یک آلل جدید نیز که قبلاً شناسایی نشده بود در بین آلل های شناسایی شده این مطالعه مشاهده گردید. آنالیز PCR-RFLP باعث شناسایی سریع تایپ های Ovar-DRB1 و تفریق سریع بین ژنوتیپ های هموزیگوت و هتروزیگوت می گردد. نتایج مطالعه حاضر مشخص کرد که اگزون دو ناحیه ژن Ovar-DRB1 در نژاد سنگسری بسیار پلی مورف می باشد.