Molecular typing of group A bovine rotavirus of calves in the provinces of Tehran, Alborz and Qazvin

Authors

1 گروه میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران

2 گروه ویروس شناسی، انستیتو آژانس آزمایشگاه‌های دامپزشکی انگلستان

3 گروه میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج

4 کارشناس سازمان دامپزشکی کل کشور، تهران

Abstract

BACKGROUND: Group A bovine rotavirus (BRV-A) is one of the most important causes of gastroenteritis and diarrhea in newborn calves. OBJECTIVES: Major types of BRV-A in Tehran, Alborz and Qazvin were detected in this study. METHODS: A total 125 fecal samples of calves showing clinical signs of diarrhea were collected from 26 industrial dairy farms located in the provinces of Tehran, Alborz and Qazvin, during two years. RESULTS: BRV-A was detected in 39.2 % (49/125) of total samples using a commercial ELISA kit. Thirty five positive samples were analyzed by seminested multiplex RT-PCR for P and G genotyping. G10 was the most prevalent genotype, accounting for 57.1% of samples, G6 accounted for 22.9% of samples and in 5.7% of samples (2/35), mixed infection of both genotypes G6 and G10 were detected. Also, the detected P types were P[11] and P[5], accounting for 71.4% and 14.2%, respectively. In our study, none of the genotypes G8 and P[1] were detected. The incidence of genotype combinations cor-responded to the B223-like strains (G10P[11]), UK-like strains (G6P[5]) and KN4-like strains (G6P[11]) were 51.4%,14.3% and 8.6%, respectively. Mixed infections G6/G10P[11] were detected in 2.85% of all samples analyzed with RT-PCR. CONCLUSIONS: To the best of our knowledge, this is the first report about the determination of P genotypes of BRV-A and distribution of the most common BRV-A strains circulating in Iran. Our study also indicated that the incidence of the G genotypes of BRV-A in the provinces of Tehran, Alborz and Qazvin, which is one of the greatest husbandry centers in Iran, has changed in the past years. Furthermore, this finding could be valuable in rotavirus vaccine design.

Article Title [فارسی]

تعیین تیپ مولکولی روتاویروس‌های گروه A گاوی در سه استان تهران، البرز و قزوین

Authors [فارسی]

  • omid madadkar 1
  • امید مددگار 1
  • هادی کیوانفر 1
  • تقی زهرایی صالحی 1
  • اکبر مهدی زاده دستجردی 2
  • فرهاد موسی خانی 3
  • روح الله کامیابی 4
Abstract [فارسی]

زمینه مطالعه: روتاویروس های گروه A گاوی، یکی از مهمترین عوامل مسبب گاستروانتریت و اسهال در گوساله های تازه متولد شده هستند.هدف:‌ ‌در این مطالعه تیپ های اصلی این ویروس ها با روش های مولکولی تعیین تیپ شدند. روش کار:‌ ‌در طی دو سال 125 نمونه مدفوع از گوساله های زیر دو ماه مبتلا به اسهال از 26 گاوداری صنعتی استان های تهران،البرز و قزوین که از بزرگترین مراکز پرورش گاو در ایران هستند، جمع آوری شدند. با استفاده از روش ELISA حضور روتاویروسهای گروه A در 2/39( %49 از 125) کل نمونه‌ها مورد تایید قرار گرفت.به منظور تعیین ژنوتیپ های G و P 35 نمونه مثبت در آزمون ELISA با استفاده از seminested multiplex RT-PCR مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج:‌از میان ژنوتیپ های G حضور ژنوتیپ های ‌ 10G(1/57)% و ‌ 6G(9/22)% مورد تایید قرار گرفت. عفونت همزمان با دو ژنوتیپ ‌10G و ‌6G در 7/5( %2 از 35) نمونه ها دیده شد.همچنین در مورد ژنوتیپ های P، ]11P[‌ شایع ترین ژنوتیپ شناخته شد (4/71)% و بعد از آن ژنوتیپ ‌ ]5P[(3/14)% قرار داشت. در این مطالعه ژنوتیپ های ‌8G و ‌]1P‌ [ دیده نشد. ترکیب ژنوتیپ های موجود در این مطالعه شامل ‌-like strains223] (B11P[10G)، ] (UK-like strains)5P[6G و ‌-like strains)4] (KN11P[6G بود که درصد وقوع هرکدام به ترتیب 4/51، 3/14و 6/8 بود. در 85/2% نمونه‌ها ترکیب ژنتیکی ]11P[10/G6G دیده شد. نتیجه‌گیری‌نهایی:‌‌بنا بر اطلاعات موجود، در این مطالعه برای اولین بار ژنوتیپ‌های P روتاویروس های گروه A گاو در ایران انجام شده است. همچنین در این مطالعه برای اولین بار در ایران ترکیب کامل ژنوتیپی رایج ترین سویه های روتاویروس گروه A گاوی، گزارش می شود. نتیجه این تحقیق همچنین حاکی از آن است که در طی سالهای اخیر میزان وقوع ژنوتیپ های G در سه استان تهران، البرز و قزوین نسبت به مطالعات قبلی تغییر یافته است.