Detection of gene expression and sequence analysis of chicken class II trans activator (CIITA)

Authors

Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran

Abstract

BACKGROUND:Class II transactivator (CIITA) is a dominant
transcriptional element, controlling numerous genes in the
immune system. CIITA is expressed in a constitutive pattern in
antigen presenting cells although its expression can occur in
other cell types. Since the revelation of CIITA, there have been
considerable advances toward understanding its role as an
activator of MHC II genes in humans and mice; nonetheless,
there is a lack of published data for this gene in other animals such
as chickens. OBJECTIVES: The goals of this study were to
determine the expression of class II transactivator (CIITA) in
chicken and analysis of the CIITA gene sequence between four
Iranian indigenous chicken ecotypes. METHODS:After securing
the research accuracy and optimization of reaction conditions,
cDNA and DNA samples of gene were obtained from four
Iranian indigenous chicken ecotypes. The PCR and RT-PCR
products were sequenced and the data were analyzed by
bioinformatics software. RESULTS: Comparison of the
sequencing results with the reference sequence of the red jungle
fowl revealed that these sequences belonged to the predicted
CIITA gene. There was a high conservation rate in the sequence
of CIITA. CONCLUSIONS: Our results indicated that like other
species, CIITA is transcripted in chickens' immune system cells.
Further studies on chickens must be done to reveal CIITAroles in
immune responses of chickens.

Keywords


Article Title [فارسی]

بررسی بیان و آنالیز توالی ژن CIITA در ماکیان

Authors [فارسی]

  • محمد خسروی
  • غلامرضا نیکبخت بروجنی
گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
Abstract [فارسی]

زمینه مطالعه: فعال کننده ترانس کلاس دو ‌(CIITA)‌ از عوامل تنظیم کننده رونوشت برداری است که بیان چندین ژن در سیستم ایمنی را کنترل می نماید. بیان ‌CIITA‌ می‌تواند به صورت دائمی در سلول‌های عرضه کننده پادگن و یا به صورت القایی در دیگر سلول‌های بدن باشد. در سال‌های اخیر پیشرفت‌هایی در زمینه درک نقش این مولکول در انسان و موش حاصل شده است ولی در زمینه این ژن در سایر حیوانات از قبیل ماکیان اطلاعات منتشر شده‌ای وجود ندارد. هدف: ‌هدف این مطالعه بررسی بیان ژن ‌CIITA‌ و مطالعه فیلوژنتیکی توالی آن است. مقایسه توالی ژن ‌CIITA‌ در طیور بومی ایران با توالی ‌red jungle fowl‌ به منظور مشخص نمودن تغییرات از دیگر اهداف است. روش کار:‌ ‌پس از اطمینان از صحت آزمایش و بهینه سازی واکنش، ‌DNA‌ و ‌ cDNA‌ مربوط به ژن مورد نظر از چهار سویه ماکیان بومی ایران به دست آمد. نمونه‌های حاصل از ‌PCR‌ و ‌RT-PCR‌ پس از تعیین توالی توسط نرم افزارهای بیوانفورماتیک مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج: نتایج این تحقیق نشان دهنده بیان ژن ‌CIITA‌ در گلبول‌های سفید خون و طحال ماکیان است. برخلاف اطلاعات موجود در پایگاه‌های اطلاعاتی ناحیه مورد بررسی فاقد اینترون می باشد. نتیجه گیری نهایی: قطعه بررسی شده در ماکیان  همانند انسان و سایر حیوانات بسیار حفاظت  شده است.  بیان ژن ‌CIITA‌ در ماکیان بیانگر آن است که احتمالاً این پروتئین درپاسخ ایمنی ماکیان نیز همانند انسان و سایر حیوانات نقش دارد که لازم است در مطالعات آینده روشن شود.

Keywords [فارسی]

  • ماکیان
  • بیان ژن CIITA
  • ایمنی