Molecular typing of avian Escherichia coli isolates by enterobacterial repetitive intergenic consensus sequences-polymerase chain reaction (ERIC-PCR)

Authors

1 گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران _ گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه آزاد اسلامی واحد گرمسار

2 گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران

3 گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه آزاد اسلامی واحد گرمسار

4 گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه آزاد اسلامی واحد گرمسار

Abstract

BACKGROUND: Colibacillosis is one of the most economically important diseases of poultry worldwide. OBJECTIVES: This study was conducted to examine the clonal relatedness and typing of 95 avian Escherichia coli isolates by ERIC-PCR. METHODS: Sixty-three E. coli isolates from two common manifestations of colibacillosis (yolk sac infection and colisepticemia) and 32 isolates from feces of apparently healthy broilers were provided. The PCR amplification reactions were performed in duplicate for all isolates. RESULTS: The molecular weight of the observed bands on gel electrophoresis ranged from 232 bp to 2690 bp. Sixty-five fingerprinting patterns were observed among 95 isolates on the basis of molecular weights and the number of bands. The numbers of 20, 22, and 23 fingerprinting patterns were found among isolates from yolk sac infection, colisepticemia, and feces, respectively. Among different fingerprinting patterns, the number of produced bands differed from 2 to 11. No identical pattern was observed among isolates of three sources. Isolates showing similar patterns in each source group belonged to a single farm. However, a few isolates that had been isolated from different farms also showed similar fingerprinting patterns. CONCLUSIONS: In conclusion, this study showed a high degree of polymorphism among E. coli isolates originated from different poultry sources when the respective bacterial genomes were analyzed by the ERIC-PCR and that no specific genotypes were responsible for different manifest-ations of colibacillosis.

Keywords


Article Title [فارسی]

تایپینگ ملکولی جدایه‌های اشریشیاکلی طیور با به کارگیری روش ERIC-PCR

Authors [فارسی]

  • Seyed Mostafa Peighambari 1
  • سید مصطفی پیغمبری 2
  • مهدی عسکری بدویی 3
  • اوستا صدرزاده 4
Abstract [فارسی]

کلی باسیلوز در سرتاسر دنیا به عنوان یکی از پر اهمیت ترین بیماری‌های طیور از نظر اقتصادی محسوب می‌گردد. هدف: این مـطـالعه به منظور ارزیابی سطح ارتباط کلونال و تایپینگ ملکولی 95 جدایه اشریشیاکلی طیور توسط آزمون ERIC-PCR انجام گرفت. روش‌کار:‌ ‌تعداد 63 جدایه اشریشیاکلی از دو تظاهر بالینی متداول کلی باسیلوز (عفونت کیسه زرده و کلی سپتیسمی) و 32 جدایه از مدفوع ماکیان گوشتی ظاهرا سالم جداسازی شد. هر یک از جدایه‌های مذکور 2 بار تحت آزمون PCR قرار گرفت. نتایج:‌ ‌وزن ملکولی باندهای مشاهده شده برروی ژل الکتروفورز از 232 تا 2690 جفت باز متغییر بود. بر اساس تعداد و وزن ملکولی باندهای تشکیل شده 65 الگوی انگشت نگاری متفاوت توسط 95 جدایه مذکور نشان داده شد. تعداد 20، 22 و 23 الگوی انگشت نگاری متفاوت به ترتیب در بین جدایه‌های حاصل از عفونت کیسه زرده، کلی سپتیسمی و مدفوع مورد شناسایی قرار گرفت. مابین الگوهای انگشت نگاری متفاوت، تعداد باندهای تشکیل شده از 2 تا 11 عدد متغییر بود. هیچ الگوی انگشت نگاری مشابهی مابین جدایه‌های متعلق به 3 منبع ذکر شده مشاهده نگردید. جدایه‌هایی نیز که در هر یک از گروه‌ها الگوهای انگشت نگاری مشابهی نشان می‌دادند، از یک مزرعه واحد جداسازی شده بودند. با این حال، تعداد اندکی از جدایه‌های جداسازی شده از مزارع متفاوت نیز الگوهای انگشت نگاری یکسان ایجاد نمودند. نتیجه گیری نهایی: در پایان، این مطالعه بیانگر حضور سطح بالایی از پلی مورفیسم مابین جدایه‌های اشریشیاکلی به دست آمده از منابع مختلف بوده و بر این اساس می توان بیان نمود که تظاهرات بالینی متفاوت کلی باسیلوز توسط ژنوتایپ‌های اختصاصی ایجاد نمی گردند.